Пакет: python3-cyvcf2 (0.31.1-2 и други)

[ Източник: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Други пакети, свързани с python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.14) [не ia64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.13~) [не ia64]

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy [не ia64]

  Python library for numerical computations (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [ia64]

• dep: python3-numpy-abi9 [ia64]

  виртуален пакет, предлаган от python3-numpy

• dep: python3-numpy2-abi0 [не ia64]

  виртуален пакет, предлаган от python3-numpy

  или python3-numpy-abi9

  виртуален пакет, предлаган от python3-numpy

Изтегляне на python3-cyvcf2

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	0.31.1-2+b3	850,2 кБ	5 691,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	0.31.1-2+b3	886,6 кБ	5 624,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	0.31.1-2+b3	849,1 кБ	5 559,0 кБ	[списък на файловете]
armel	0.31.1-2+b3	848,3 кБ	5 549,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	0.31.1-2+b3	852,8 кБ	5 357,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	0.31.1-2+b3	871,2 кБ	5 942,0 кБ	[списък на файловете]
i386	0.31.1-2+b4	881,9 кБ	5 645,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	0.30.28-1+b1	1 027,9 кБ	6 797,0 кБ	[списък на файловете]
loong64 (неофициална архитектура)	0.31.1-2+b3	870,9 кБ	5 623,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	0.31.1-2+b3	494,1 кБ	4 464,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	0.31.1-2+b3	825,7 кБ	5 642,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	0.31.1-2+b3	868,6 кБ	5 751,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	0.31.1-2+b3	874,6 кБ	5 751,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	0.31.1-2+b3	883,3 кБ	5 403,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	0.31.1-2+b3	864,6 кБ	5 594,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	0.31.1-2+b3	615,1 кБ	4 497,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	0.31.1-2+b3	835,4 кБ	5 823,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	0.31.1-2+b3	892,5 кБ	5 570,0 кБ	[списък на файловете]