Paket: python3-cyvcf2 (0.31.1-2 och andra)

Länkar för python3-cyvcf2

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet cyvcf2:

Ansvariga:

Debian Med Packaging Team (QA-sida, E-postarkiv)
Steffen Moeller (QA-sida)
Liubov Chuprikova (QA-sida)
Étienne Mollier (QA-sida)

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Andra paket besläktade med python3-cyvcf2

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

dep: python3 (<< 3.14) [ej ia64]

dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

dep: python3 (>= 3.13~) [ej ia64]
dep: python3-click

Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x
dep: python3-coloredlogs

colored terminal output for Python 3's logging module
dep: python3-numpy [ej ia64]

Python library for numerical computations (Python 3)

dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [ia64]
dep: python3-numpy-abi9 [ia64]

virtuellt paket som tillhandahålls av python3-numpy
dep: python3-numpy2-abi0 [ej ia64]

virtuellt paket som tillhandahålls av python3-numpy

eller python3-numpy-abi9

virtuellt paket som tillhandahålls av python3-numpy

Hämta python3-cyvcf2

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	0.31.1-2+b3	850,2 kbyte	5.691,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	0.31.1-2+b3	886,6 kbyte	5.624,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	0.31.1-2+b3	849,1 kbyte	5.559,0 kbyte	[filförteckning]
armel	0.31.1-2+b3	848,3 kbyte	5.549,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	0.31.1-2+b3	852,8 kbyte	5.357,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	0.31.1-2+b3	871,2 kbyte	5.942,0 kbyte	[filförteckning]
i386	0.31.1-2+b4	881,9 kbyte	5.645,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	0.30.28-1+b1	1.027,9 kbyte	6.797,0 kbyte	[filförteckning]
loong64 (inofficiell anpassning)	0.31.1-2+b3	870,9 kbyte	5.623,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	0.31.1-2+b3	494,1 kbyte	4.464,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	0.31.1-2+b3	825,7 kbyte	5.642,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	0.31.1-2+b3	868,6 kbyte	5.751,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	0.31.1-2+b3	874,6 kbyte	5.751,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	0.31.1-2+b3	883,3 kbyte	5.403,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	0.31.1-2+b3	864,6 kbyte	5.594,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	0.31.1-2+b3	615,1 kbyte	4.497,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	0.31.1-2+b3	835,4 kbyte	5.823,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	0.31.1-2+b3	892,5 kbyte	5.570,0 kbyte	[filförteckning]