Paket: python3-cyvcf2 (0.31.1-2 och andra)

[ Källkod: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Andra paket besläktade med python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.7) [ej alpha, amd64, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [ej ia64]

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  virtuellt paket som tillhandahålls av python3-numpy

Hämta python3-cyvcf2

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	0.31.1-2	846,6 kbyte	5.669,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	0.31.1-2	877,9 kbyte	5.581,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	0.31.1-2	840,7 kbyte	5.472,0 kbyte	[filförteckning]
armel	0.31.1-2	843,4 kbyte	5.482,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	0.31.1-2	846,9 kbyte	5.278,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	0.31.1-2	869,4 kbyte	5.939,0 kbyte	[filförteckning]
i386	0.31.1-2	880,5 kbyte	5.627,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	0.30.28-1+b1	1.027,9 kbyte	6.797,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	0.31.1-2	492,2 kbyte	4.434,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	0.31.1-2	819,9 kbyte	5.554,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	0.31.1-2	864,3 kbyte	5.728,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	0.31.1-2	869,0 kbyte	5.664,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	0.31.1-2	874,1 kbyte	5.360,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	0.31.1-2	858,2 kbyte	5.556,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	0.31.1-2	606,4 kbyte	4.411,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	0.31.1-2	831,7 kbyte	5.800,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	0.31.1-2	889,1 kbyte	5.543,0 kbyte	[filförteckning]