Paketti: python3-cyvcf2 (0.31.1-2 ja muut)

[ Source: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Muut pakettiin python3-cyvcf2 liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.14) [ei ia64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.13~) [ei ia64]

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy [ei ia64]

  Python library for numerical computations (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [ia64]

• dep: python3-numpy-abi9 [ia64]

  näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy

• dep: python3-numpy2-abi0 [ei ia64]

  näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy

  tai python3-numpy-abi9

  näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy

Imuroi python3-cyvcf2

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	0.31.1-2+b3	850.2 kt	5,691.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	0.31.1-2+b3	886.6 kt	5,624.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.31.1-2+b3	849.1 kt	5,559.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.31.1-2+b3	848.3 kt	5,549.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.31.1-2+b3	852.8 kt	5,357.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	0.31.1-2+b3	871.2 kt	5,942.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.31.1-2+b4	881.9 kt	5,645.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	0.30.28-1+b1	1,027.9 kt	6,797.0 kt	[tiedostoluettelo]
loong64 (epävirallinen siirros)	0.31.1-2+b3	870.9 kt	5,623.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	0.31.1-2+b3	494.1 kt	4,464.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.31.1-2+b3	825.7 kt	5,642.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	0.31.1-2+b3	868.6 kt	5,751.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.31.1-2+b3	874.6 kt	5,751.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	0.31.1-2+b3	883.3 kt	5,403.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.31.1-2+b3	864.6 kt	5,594.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	0.31.1-2+b3	615.1 kt	4,497.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	0.31.1-2+b3	835.4 kt	5,823.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	0.31.1-2+b3	892.5 kt	5,570.0 kt	[tiedostoluettelo]