Pacote: abyss (2.2.5+dfsg-1)

[ Fonte: abyss  ]

montador sequencial, paralelo, de novo para leituras curtas

ABySS é um montador paralelo, sequencial, 'de novo', concebido para leituras curtas. Pode ser utilizado para montar dados de sequência de genoma ou transcritoma. A paralelização é conseguida utilizando MPI, OpenMP e pthread.

Etiquetas: Campo: Biologia, Implementado em: C, Interface de usuário(a): Linha de comando, Função: Programa

Outros pacotes relacionados a abyss

• dep: bsdextrautils

  utilitários extras do 4.4BSD-Lite

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, s390x]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  biblioteca compartilhada SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [não armel, armhf]

• dep: make

  utilitário para compilação direta

• dep: openmpi-bin

  biblioteca de passagem de mensagens de alto desempenho -- binários

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  Linguagem de extração e relatórios prática de Larry Wall

Download de abyss

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	2,939.3 kB	9,045.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	2,764.0 kB	8,373.0 kB	[lista de arquivos]
armel	2,752.4 kB	8,369.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	2,798.8 kB	6,741.0 kB	[lista de arquivos]
i386	3,029.7 kB	9,589.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	2,868.5 kB	10,460.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	2,897.2 kB	10,313.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	2,895.8 kB	11,637.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	2,755.5 kB	9,053.0 kB	[lista de arquivos]