软件包：abyss（2.2.5+dfsg-1）

[ 源代码： abyss  ]

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

标签: 领域: 生物学, 实做语言: C, 用户接口: 命令行, 角色: 程序

其他与 abyss 有关的软件包

• dep: bsdextrautils

  extra utilities from 4.4BSD-Lite

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, s390x]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP（GOMP）支持库

• dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  SQLite 3 共享库

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  GNU 标准 C++ 库，第3版

  dep: libstdc++6 (>= 9) [除 armel, armhf]

• dep: make

  utility for directing compilation

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  拉里 沃尔的实用报表提取语言(Perl)

下载 abyss

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	软件包大小	安装后大小	文件
amd64	2,939.3 kB	9,045.0 kB	[文件列表]
arm64	2,764.0 kB	8,373.0 kB	[文件列表]
armel	2,752.4 kB	8,369.0 kB	[文件列表]
armhf	2,798.8 kB	6,741.0 kB	[文件列表]
i386	3,029.7 kB	9,589.0 kB	[文件列表]
mips64el	2,868.5 kB	10,460.0 kB	[文件列表]
mipsel	2,897.2 kB	10,313.0 kB	[文件列表]
ppc64el	2,895.8 kB	11,637.0 kB	[文件列表]
s390x	2,755.5 kB	9,053.0 kB	[文件列表]