Package: abyss (2.3.5+dfsg-2)

[ Source: abyss  ]

montador sequencial, paralelo, de novo para leituras curtas

ABySS é um montador paralelo, sequencial, 'de novo', concebido para leituras curtas. Pode ser utilizado para montar dados de sequência de genoma ou transcritoma. A paralelização é conseguida utilizando MPI, OpenMP e pthread.

Tags: Field: Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program

Other Packages Related to abyss

• dep: bsdextrautils

  utilitários extras do 4.4BSD-Lite

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not ppc64el]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  biblioteca compartilhada SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 12)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: make

  utilitário para compilação direta

• dep: openmpi-bin

  biblioteca de passagem de mensagens de alto desempenho -- binários

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  Linguagem de extração e relatórios prática de Larry Wall

Download abyss

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	3,116.2 kB	9,583.0 kB	[list of files]
arm64	2,893.9 kB	10,163.0 kB	[list of files]
mips64el	3,024.1 kB	12,629.0 kB	[list of files]
ppc64el	3,078.8 kB	12,339.0 kB	[list of files]
s390x	2,894.7 kB	9,611.0 kB	[list of files]