Paquet : abyss (2.2.5+dfsg-1)

[ Paquet source : abyss  ]

assembleur de séquences de novo parallèles pour les lectures courtes

ABySS est un assembleur de séquences de novo parallèles conçu pour les lectures courtes. Il peut servir à assembler des données de séquences de génome ou de transcriptome. La parallélisation est permise par MPI, OpenMP et pthread.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Mis en œuvre en: C, Interface utilisateur: Ligne de commande, Rôle: Programme

Autres paquets associés à abyss

• dep: bsdextrautils

  utilitaires supplémentaires de 4.4BSD-Lite

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, s390x]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Bibliothèque partagée SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [non armel, armhf]

• dep: make

  utilitaire pour mener la compilation

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

Télécharger abyss

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	2 939,3 ko	9 045,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2 764,0 ko	8 373,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2 752,4 ko	8 369,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2 798,8 ko	6 741,0 ko	[liste des fichiers]
i386	3 029,7 ko	9 589,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2 868,5 ko	10 460,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	2 897,2 ko	10 313,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2 895,8 ko	11 637,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2 755,5 ko	9 053,0 ko	[liste des fichiers]