[ ソース: abyss ]
パッケージ: abyss (2.2.5+dfsg-1)
de novo, parallel, sequence assembler for short reads
ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.
その他の abyss 関連パッケージ
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- dep: bsdextrautils
- 4.4BSD-Lite 由来の追加ユーティリティ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, s390x]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)
- high performance message passing library -- shared library
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- dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)
- SQLite 3 共有ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
- dep: libstdc++6 (>= 9) [armel, armhf 以外]
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- dep: make
- コンパイルを制御するユーティリティ
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- dep: openmpi-bin
- high performance message passing library -- binaries
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- dep: openmpi-common
- high performance message passing library -- common files
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- dep: perl
- Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語
abyss のダウンロード
アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
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amd64 | 2,939.3 kB | 9,045.0 kB | [ファイル一覧] |
arm64 | 2,764.0 kB | 8,373.0 kB | [ファイル一覧] |
armel | 2,752.4 kB | 8,369.0 kB | [ファイル一覧] |
armhf | 2,798.8 kB | 6,741.0 kB | [ファイル一覧] |
i386 | 3,029.7 kB | 9,589.0 kB | [ファイル一覧] |
mips64el | 2,868.5 kB | 10,460.0 kB | [ファイル一覧] |
mipsel | 2,897.2 kB | 10,313.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64el | 2,895.8 kB | 11,637.0 kB | [ファイル一覧] |
s390x | 2,755.5 kB | 9,053.0 kB | [ファイル一覧] |