Pacote: abyss (2.3.10-1 e outros)

[ Fonte: abyss  ]

montador sequencial, paralelo, de novo para leituras curtas

ABySS é um montador paralelo, sequencial, 'de novo', concebido para leituras curtas. Pode ser utilizado para montar dados de sequência de genoma ou transcritoma. A paralelização é conseguida utilizando MPI, OpenMP e pthread.

Etiquetas: Campo: Biologia, Implementado em: C, Interface de usuário(a): Linha de comando, Função: Programa

Outros pacotes relacionados a abyss

• dep: bsdextrautils

  utilitários extras do 4.4BSD-Lite

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [não ppc64el, riscv64]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [não s390x]

  high performance message passing library -- shared library

  dep: libopenmpi40 (>= 5.0.7) [s390x]

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  biblioteca compartilhada SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: make

  utilitário para compilação direta

• dep: openmpi-bin

  biblioteca de passagem de mensagens de alto desempenho -- binários

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  Linguagem de extração e relatórios prática de Larry Wall

Download de abyss

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	2.3.10-1+b1	3,246.5 kB	10,021.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	2.3.10-1+b1	3,000.6 kB	10,681.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	2.3.10-1+b1	3,135.6 kB	12,561.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	2.3.10-1+b1	3,163.1 kB	12,409.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	2.3.10-1+b1	3,185.2 kB	8,245.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	2.3.10-1	3,156.1 kB	10,176.0 kB	[lista de arquivos]