Пакет: abyss (2.2.5+dfsg-1)

[ Източник: abyss  ]

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Етикети: Field: Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program

Други пакети, свързани с abyss

• dep: bsdextrautils

  extra utilities from 4.4BSD-Lite

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, s390x]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  SQLite 3 shared library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [не armel, armhf]

• dep: make

  utility for directing compilation

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

Изтегляне на abyss

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	2 939,3 кБ	9 045,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2 764,0 кБ	8 373,0 кБ	[списък на файловете]
armel	2 752,4 кБ	8 369,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	2 798,8 кБ	6 741,0 кБ	[списък на файловете]
i386	3 029,7 кБ	9 589,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	2 868,5 кБ	10 460,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	2 897,2 кБ	10 313,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	2 895,8 кБ	11 637,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	2 755,5 кБ	9 053,0 кБ	[списък на файловете]