Paquet : probalign (1.4-10)

[ Paquet source : probalign  ]

alignement de séquences multiples en utilisant les probabilités à postériori de la fonction de partition

Probalign utilise l’estimation de probabilités à postériori de la fonction de partition pour calculer les alignements de séquence multiple avec la précision maximale attendue. Il obtient des résultats statistiquement significativement meilleurs que les programmes d´alignement leaders Probcons v1.1, MAFFT v5.851 et MUSCLE v3.6 avec les tests de performance BAliBASE 3.0, HOMSTRAD et OXBENCH. Les améliorations de Probalign sont plus importantes sur les ensembles de données contenant des extrémités N/C-terminales et sur les ensembles de données avec des séquences de longueurs hétérogènes. Sur les ensembles de données de longueurs hétérogènes contenant des répétitions, la précision d’alignement de Probalign est 10 % et 15 % meilleure que les trois autres méthodes quand l´écart-type de longueur est au moins 300 et 400.

Autres paquets associés à probalign

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, ppc64el]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

Télécharger probalign

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	68,9 ko	175,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	64,6 ko	219,0 ko	[liste des fichiers]
armel	55,1 ko	142,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	53,9 ko	114,0 ko	[liste des fichiers]
i386	61,4 ko	158,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	65,4 ko	223,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	64,2 ko	221,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	78,4 ko	219,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	56,7 ko	171,0 ko	[liste des fichiers]