Paquet : garli-mpi (2.1-9 et autres)

[ Paquet source : garli  ]

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference is a program for inferring phylogenetic trees. Using an approach similar to a classical genetic algorithm, it rapidly searches the space of evolutionary trees and model parameters to find the solution maximizing the likelihood score. It implements nucleotide, amino acid and codon-based models of sequence evolution, and runs on all platforms. The latest version adds support for partitioned models and morphology-like datatypes.

This version of Garli is using MPI.

Autres paquets associés à garli-mpi

• dep: libc6 (>= 2.38) [non arm64, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [arm64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libmpich12 [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

  Shared libraries for MPICH

  dep: libmpich12 (>= 4.2.0) [x32]

• dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]

  NEXUS Class Library

  dep: libncl2 (>= 2.1.21+git20210811.b1213a7) [non amd64]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [ia64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: mpi-default-bin [non ia64]

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• dep: openmpi-bin [ia64]

  high performance message passing library -- binaries

Télécharger garli-mpi

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	2.1-9	622,2 ko	1 656,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.1-9	560,1 ko	1 428,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2.1-9	537,3 ko	1 427,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2.1-9	505,2 ko	979,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	2.1-9	595,3 ko	1 508,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.1-9	556,0 ko	1 571,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2.1-7+b1	937,5 ko	3 298,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	2.1-9	501,8 ko	1 531,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.1-9	609,3 ko	1 838,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2.1-9	639,1 ko	1 812,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.1-9	687,3 ko	1 748,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.1-9	657,0 ko	1 272,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2.1-9	509,1 ko	1 572,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	2.1-9	677,7 ko	1 364,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	2.1-9	528,8 ko	2 075,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	2.1-9	622,9 ko	1 615,0 ko	[liste des fichiers]