Paket: garli-mpi (2.1-7 und andere)

[ Quellcode: garli  ]

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference is a program for inferring phylogenetic trees. Using an approach similar to a classical genetic algorithm, it rapidly searches the space of evolutionary trees and model parameters to find the solution maximizing the likelihood score. It implements nucleotide, amino acid and codon-based models of sequence evolution, and runs on all platforms. The latest version adds support for partitioned models and morphology-like datatypes.

This version of Garli is using MPI.

Andere Pakete mit Bezug zu garli-mpi

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht arm64, ia64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]

  NEXUS Class Library

  dep: libncl2 (>= 2.1.21+git20210811.b1213a7) [nicht amd64]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [nicht arm64]

  Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken

  dep: libopenmpi3t64 (>= 5.0.5) [arm64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: openmpi-bin

  Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Programmdateien

garli-mpi herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	2.1-7+b1	619,2 kB	1.685,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.1-7+b2	560,0 kB	1.429,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	2.1-7+b1	513,8 kB	1.376,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	2.1-7+b1	488,1 kB	952,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	2.1-7+b1	591,1 kB	1.508,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	2.1-7+b1	547,4 kB	1.580,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.1-7+b1	937,5 kB	3.298,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	2.1-7+b1	519,4 kB	1.604,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2.1-7+b1	592,0 kB	1.849,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	2.1-7+b1	631,8 kB	1.813,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.1-7+b1	685,6 kB	1.813,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.1-7+b2	646,5 kB	1.285,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	2.1-7+b1	499,3 kB	1.589,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	2.1-7+b1	673,2 kB	1.430,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	2.1-7+b1	519,3 kB	2.080,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	2.1-7+b1	621,0 kB	1.644,0 kB	[Liste der Dateien]