Пакет: garli-mpi (2.1-7 и другие)

[ Источник: garli  ]

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference is a program for inferring phylogenetic trees. Using an approach similar to a classical genetic algorithm, it rapidly searches the space of evolutionary trees and model parameters to find the solution maximizing the likelihood score. It implements nucleotide, amino acid and codon-based models of sequence evolution, and runs on all platforms. The latest version adds support for partitioned models and morphology-like datatypes.

This version of Garli is using MPI.

Другие пакеты, относящиеся к garli-mpi

• dep: libc6 (>= 2.34) [не arm64, ia64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]

  NEXUS Class Library

  dep: libncl2 (>= 2.1.21+git20210811.b1213a7) [не amd64]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [не arm64]

  high performance message passing library -- shared library

  dep: libopenmpi3t64 (>= 5.0.5) [arm64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

Загрузка garli-mpi

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	2.1-7+b1	619,2 Кб	1 685,0 Кб	[список файлов]
arm64	2.1-7+b2	560,0 Кб	1 429,0 Кб	[список файлов]
armel	2.1-7+b1	513,8 Кб	1 376,0 Кб	[список файлов]
armhf	2.1-7+b1	488,1 Кб	952,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	2.1-7+b1	591,1 Кб	1 508,0 Кб	[список файлов]
i386	2.1-7+b1	547,4 Кб	1 580,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	2.1-7+b1	937,5 Кб	3 298,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	2.1-7+b1	519,4 Кб	1 604,0 Кб	[список файлов]
mips64el	2.1-7+b1	592,0 Кб	1 849,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	2.1-7+b1	631,8 Кб	1 813,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	2.1-7+b1	685,6 Кб	1 813,0 Кб	[список файлов]
riscv64	2.1-7+b2	646,5 Кб	1 285,0 Кб	[список файлов]
s390x	2.1-7+b1	499,3 Кб	1 589,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	2.1-7+b1	673,2 Кб	1 430,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	2.1-7+b1	519,3 Кб	2 080,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	2.1-7+b1	621,0 Кб	1 644,0 Кб	[список файлов]