Paquet : garli-mpi (2.1-3)

[ Paquet source : garli  ]

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference is a program for inferring phylogenetic trees. Using an approach similar to a classical genetic algorithm, it rapidly searches the space of evolutionary trees and model parameters to find the solution maximizing the likelihood score. It implements nucleotide, amino acid and codon-based models of sequence evolution, and runs on all platforms. The latest version adds support for partitioned models and morphology-like datatypes.

This version of Garli is using MPI.

Autres paquets associés à garli-mpi

• dep: libc6 (>= 2.15) [armhf, i386]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.22) [amd64]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [non armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libncl2 [non amd64]

  NEXUS Class Library

  dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]

• dep: libopenmpi3

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

Télécharger garli-mpi

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	543,0 ko	1 416,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	499,7 ko	1 228,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	431,4 ko	839,0 ko	[liste des fichiers]
i386	484,1 ko	1 295,0 ko	[liste des fichiers]