パッケージ: garli-mpi (2.1-9 など)

[ ソース: garli  ]

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference is a program for inferring phylogenetic trees. Using an approach similar to a classical genetic algorithm, it rapidly searches the space of evolutionary trees and model parameters to find the solution maximizing the likelihood score. It implements nucleotide, amino acid and codon-based models of sequence evolution, and runs on all platforms. The latest version adds support for partitioned models and morphology-like datatypes.

This version of Garli is using MPI.

その他の garli-mpi 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.38) [arm64, ia64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [arm64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libmpich12 [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

  Shared libraries for MPICH

  dep: libmpich12 (>= 4.2.0) [x32]

• dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]

  NEXUS Class Library

  dep: libncl2 (>= 2.1.21+git20210811.b1213a7) [amd64 以外]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [ia64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: mpi-default-bin [ia64 以外]

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• dep: openmpi-bin [ia64]

  high performance message passing library -- binaries

garli-mpi のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	2.1-9	622.2 kB	1,656.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.1-9	560.1 kB	1,428.0 kB	[ファイル一覧]
armel	2.1-9	537.3 kB	1,427.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	2.1-9	505.2 kB	979.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	2.1-9	595.3 kB	1,508.0 kB	[ファイル一覧]
i386	2.1-9	556.0 kB	1,571.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	2.1-7+b1	937.5 kB	3,298.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	2.1-9	501.8 kB	1,531.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.1-9	609.3 kB	1,838.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	2.1-9	639.1 kB	1,812.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.1-9	687.3 kB	1,748.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	2.1-9	657.0 kB	1,272.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.1-9	509.1 kB	1,572.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	2.1-9	677.7 kB	1,364.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	2.1-9	528.8 kB	2,075.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	2.1-9	622.9 kB	1,615.0 kB	[ファイル一覧]