软件包：garli-mpi（2.1-9 以及其他的）

[ 源代码： garli  ]

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference is a program for inferring phylogenetic trees. Using an approach similar to a classical genetic algorithm, it rapidly searches the space of evolutionary trees and model parameters to find the solution maximizing the likelihood score. It implements nucleotide, amino acid and codon-based models of sequence evolution, and runs on all platforms. The latest version adds support for partitioned models and morphology-like datatypes.

This version of Garli is using MPI.

其他与 garli-mpi 有关的软件包

• dep: libc6 (>= 2.38) [除 arm64, ia64, sh4]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [arm64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支持库

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支持库

• dep: libmpich12 [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

  Shared libraries for MPICH

  dep: libmpich12 (>= 4.2.0) [x32]

• dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]

  NEXUS Class Library

  dep: libncl2 (>= 2.1.21+git20210811.b1213a7) [除 amd64]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [ia64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 标准 C++ 库，第3版

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: mpi-default-bin [除 ia64]

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• dep: openmpi-bin [ia64]

  high performance message passing library -- binaries

下载 garli-mpi

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
amd64	2.1-9	622.2 kB	1,656.0 kB	[文件列表]
arm64	2.1-9	560.1 kB	1,428.0 kB	[文件列表]
armel	2.1-9	537.3 kB	1,427.0 kB	[文件列表]
armhf	2.1-9	505.2 kB	979.0 kB	[文件列表]
hppa （非官方移植版）	2.1-9	595.3 kB	1,508.0 kB	[文件列表]
i386	2.1-9	556.0 kB	1,571.0 kB	[文件列表]
ia64 （非官方移植版）	2.1-7+b1	937.5 kB	3,298.0 kB	[文件列表]
m68k （非官方移植版）	2.1-9	501.8 kB	1,531.0 kB	[文件列表]
mips64el	2.1-9	609.3 kB	1,838.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	2.1-9	639.1 kB	1,812.0 kB	[文件列表]
ppc64el	2.1-9	687.3 kB	1,748.0 kB	[文件列表]
riscv64	2.1-9	657.0 kB	1,272.0 kB	[文件列表]
s390x	2.1-9	509.1 kB	1,572.0 kB	[文件列表]
sh4 （非官方移植版）	2.1-9	677.7 kB	1,364.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	2.1-9	528.8 kB	2,075.0 kB	[文件列表]
x32 （非官方移植版）	2.1-9	622.9 kB	1,615.0 kB	[文件列表]