Paquet : garli-mpi (2.1-7)

[ Paquet source : garli  ]

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference is a program for inferring phylogenetic trees. Using an approach similar to a classical genetic algorithm, it rapidly searches the space of evolutionary trees and model parameters to find the solution maximizing the likelihood score. It implements nucleotide, amino acid and codon-based models of sequence evolution, and runs on all platforms. The latest version adds support for partitioned models and morphology-like datatypes.

This version of Garli is using MPI.

Autres paquets associés à garli-mpi

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]

  NEXUS Class Library

  dep: libncl2 (>= 2.1.21+git20210811.b1213a7) [non amd64]

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.2)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

Télécharger garli-mpi

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	601,8 ko	1 640,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	551,6 ko	1 432,0 ko	[liste des fichiers]
armel	493,7 ko	1 319,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	472,4 ko	919,0 ko	[liste des fichiers]
i386	534,4 ko	1 535,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	590,4 ko	1 833,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	587,2 ko	1 743,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	669,9 ko	1 812,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	492,4 ko	1 572,0 ko	[liste des fichiers]