Paquet : garli-mpi (2.1-9)

[ Paquet source : garli  ]

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference is a program for inferring phylogenetic trees. Using an approach similar to a classical genetic algorithm, it rapidly searches the space of evolutionary trees and model parameters to find the solution maximizing the likelihood score. It implements nucleotide, amino acid and codon-based models of sequence evolution, and runs on all platforms. The latest version adds support for partitioned models and morphology-like datatypes.

This version of Garli is using MPI.

Autres paquets associés à garli-mpi

• dep: libc6 (>= 2.38) [non arm64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, riscv64]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libmpich12 [armel, armhf, i386]

  Shared libraries for MPICH

• dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]

  NEXUS Class Library

  dep: libncl2 (>= 2.1.21+git20210811.b1213a7) [non amd64]

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [non armel, armhf, i386]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: mpi-default-bin

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

Télécharger garli-mpi

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	622,2 ko	1 656,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	560,1 ko	1 428,0 ko	[liste des fichiers]
armel	537,3 ko	1 427,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	505,2 ko	979,0 ko	[liste des fichiers]
i386	556,0 ko	1 571,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	609,3 ko	1 838,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	687,3 ko	1 748,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	657,0 ko	1 272,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	509,1 ko	1 572,0 ko	[liste des fichiers]