Paket: garli-mpi (2.1-9 och andra)

[ Källkod: garli  ]

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference is a program for inferring phylogenetic trees. Using an approach similar to a classical genetic algorithm, it rapidly searches the space of evolutionary trees and model parameters to find the solution maximizing the likelihood score. It implements nucleotide, amino acid and codon-based models of sequence evolution, and runs on all platforms. The latest version adds support for partitioned models and morphology-like datatypes.

This version of Garli is using MPI.

Andra paket besläktade med garli-mpi

• dep: libc6 (>= 2.38) [ej arm64, ia64, loong64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [arm64, loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf, hppa, ia64, m68k, riscv64, sh4, sparc64]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC stödbibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC stödbibliotek

• dep: libmpich12 [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

  Shared libraries for MPICH

  dep: libmpich12 (>= 4.2.0) [x32]

• dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]

  NEXUS Class Library

  dep: libncl2 (>= 2.1.21+git20210811.b1213a7) [ej amd64]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [ia64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [ej armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4, x32]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: mpi-default-bin [ej ia64]

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

• dep: openmpi-bin [ia64]

  high performance message passing library -- binaries

Hämta garli-mpi

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	2.1-9	622,2 kbyte	1.656,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	2.1-9	560,1 kbyte	1.428,0 kbyte	[filförteckning]
armel	2.1-9	537,3 kbyte	1.427,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	2.1-9	505,2 kbyte	979,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	2.1-9	595,3 kbyte	1.508,0 kbyte	[filförteckning]
i386	2.1-9	556,0 kbyte	1.571,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	2.1-7+b1	937,5 kbyte	3.298,0 kbyte	[filförteckning]
loong64 (inofficiell anpassning)	2.1-9	633,1 kbyte	1.620,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	2.1-9	501,8 kbyte	1.531,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	2.1-9	609,3 kbyte	1.838,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	2.1-9	639,1 kbyte	1.812,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	2.1-9	687,3 kbyte	1.748,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	2.1-9	657,0 kbyte	1.272,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	2.1-9	509,1 kbyte	1.572,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	2.1-9	677,7 kbyte	1.364,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	2.1-9	528,8 kbyte	2.075,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	2.1-9	622,9 kbyte	1.615,0 kbyte	[filförteckning]