Paketti: python3-cyvcf2 (0.30.18-1 ja muut)

[ Source: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Muut pakettiin python3-cyvcf2 liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.7) [ei amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-click

  Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0)

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: python3-numpy-abi9

  näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy

Imuroi python3-cyvcf2

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	0.30.18-1+b2	783.8 kt	4,710.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.30.18-1+b2	755.0 kt	4,725.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.30.18-1+b2	753.1 kt	4,624.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.30.18-1+b2	754.1 kt	4,452.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.30.18-1+b2	782.4 kt	4,726.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.30.18-1+b2	735.7 kt	4,740.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	0.30.18-1+b2	735.5 kt	4,719.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.30.18-1+b2	778.0 kt	4,853.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.30.18-1+b2	745.3 kt	4,708.0 kt	[tiedostoluettelo]