Paket: vt (0.57721+ds-3 und andere)

[ Quellcode: vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Andere Pakete mit Bezug zu vt

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, arm64, armhf, ia64, loong64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64, armhf]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2) [sparc64]

  Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (GnuTLS-Variante)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

  Bibliothek für das XZ-Kompressionsformat

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  Neue »Perl Compatible Regular Expression Library« - 8-Bit-Laufzeitdateien

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [sparc64]

  Werkzeugsatz für das Secure Socket Layer (SSL) - Laufzeitbibliotheken

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libsvm3 (>= 3.21+ds) [sparc64]

  Bibliothek zur Implementierung von Support Vector Machines

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: r-base-core

  GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern

• dep: r-mathlib (>= 4.3.3) [sparc64]

  Eigenständige Mathematikbibliothek für GNU R

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

vt herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	0.57721+ds-3+b1	694,3 kB	3.221,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	0.57721+ds-3+b1	821,5 kB	2.902,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.57721+ds-3+b2	702,6 kB	2.706,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	0.57721+ds-3+b1	637,2 kB	2.361,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	0.57721+ds-3+b2	685,8 kB	1.809,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	0.57721+ds-3+b2	695,5 kB	2.646,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	0.57721+ds-3+b1	826,5 kB	3.065,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	0.57721+ds-3+b1	906,8 kB	5.619,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	0.57721+ds-3+b1	688,3 kB	2.996,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	0.57721+ds-3+b2	735,5 kB	2.777,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	0.57721+ds-3+b1	604,5 kB	3.505,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	0.57721+ds-3+b1	702,2 kB	3.218,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.57721+ds-3+b1	726,7 kB	3.090,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	0.57721+ds-3+b2	803,1 kB	2.342,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	0.57721+ds-3+b1	757,8 kB	2.834,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	0.57721+ds-3+b2	931,7 kB	2.642,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	0.57721+ds-3+b2	597,0 kB	3.097,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	0.57721+ds-3+b1	822,2 kB	2.813,0 kB	[Liste der Dateien]