Paket: vt (0.57721+ds-3)

[ Quellcode: vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Andere Pakete mit Bezug zu vt

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  Neue »Perl Compatible Regular Expression Library« - 8-Bit-Laufzeitdateien

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: r-base-core

  GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	756,2 kB	2.565,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	624,3 kB	2.241,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	604,2 kB	2.152,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	624,4 kB	1.524,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	763,0 kB	2.776,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	576,1 kB	3.225,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	580,6 kB	2.977,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	693,5 kB	2.833,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	638,5 kB	2.533,0 kB	[Liste der Dateien]