Пакет: vt (0.57721+ds-3 и други)

[ Източник: vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Други пакети, свързани с vt

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, arm64, ia64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2) [sparc64]

  easy-to-use client-side URL transfer library (GnuTLS flavour)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

  XZ-format compression library

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  New Perl Compatible Regular Expression Library- 8 bit runtime files

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [sparc64]

  Secure Sockets Layer toolkit - shared libraries

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libsvm3 (>= 3.21+ds) [sparc64]

  library implementing support vector machines

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: r-base-core

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-mathlib (>= 4.3.3) [sparc64]

  GNU R standalone mathematics library

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  compression library - runtime

Изтегляне на vt

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	0.57721+ds-3+b1	694,3 кБ	3 221,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	0.57721+ds-3+b1	821,5 кБ	2 902,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	0.57721+ds-3+b2	702,6 кБ	2 706,0 кБ	[списък на файловете]
armel	0.57721+ds-3+b1	637,2 кБ	2 361,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	0.57721+ds-3+b1	657,9 кБ	1 661,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	0.57721+ds-3+b2	695,5 кБ	2 646,0 кБ	[списък на файловете]
i386	0.57721+ds-3+b1	826,5 кБ	3 065,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	0.57721+ds-3+b1	906,8 кБ	5 619,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	0.57721+ds-3+b2	735,5 кБ	2 777,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	0.57721+ds-3+b1	604,5 кБ	3 505,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	0.57721+ds-3+b1	702,2 кБ	3 218,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	0.57721+ds-3+b1	726,7 кБ	3 090,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	0.57721+ds-3+b2	803,1 кБ	2 342,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	0.57721+ds-3+b1	757,8 кБ	2 834,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	0.57721+ds-3+b2	931,7 кБ	2 642,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	0.57721+ds-3+b2	597,0 кБ	3 097,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	0.57721+ds-3+b1	822,2 кБ	2 813,0 кБ	[списък на файловете]