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Paket: libhts3t64 (1.21+ds-1 und andere)

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Ähnliche Pakete:

C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

HTSlib ist eine Implementierung einer vereinheitlichten C-Bibliothek für den Zugriff auf gängige Dateiformate, wie SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM und VCF (Variant Call Format), die für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten verwendet werden, und ist die von samtools und bcftools verwendete Kernbibliothek. HTSlib hängt nur von zlib ab. Es ist bekannt, dass sie mit gcc, g++ und clang kompatibel ist.

HTSlib implementiert einen verallgemeinerten BAM-Index (binary SAM) mit der Dateierweiterung »csi« (coordinate-sorted index). Der HTSlib-Dateileser sucht zuerst nach dem neuen Index und dann nach dem alten, wenn der neue Index nicht vorhanden ist.

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m68k (inoffizielle Portierung) 1.21+ds-1 395,8 kB979,0 kB [Liste der Dateien]
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ppc64 (inoffizielle Portierung) 1.21+ds-1 476,5 kB1.591,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 1.21+ds-1 488,9 kB1.591,0 kB [Liste der Dateien]
riscv64 1.21+ds-1 458,7 kB932,0 kB [Liste der Dateien]
s390x 1.21+ds-1 451,5 kB1.179,0 kB [Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung) 1.21+ds-1 502,0 kB1.142,0 kB [Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung) 1.21+ds-1 391,9 kB5.264,0 kB [Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung) 1.21+ds-1 454,7 kB1.079,0 kB [Liste der Dateien]