パッケージ: vt (0.57721+ds-3 など)

[ ソース: vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

その他の vt 関連パッケージ

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, arm64, ia64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2) [sparc64]

  使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (GnuTLS フレーバ)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

  XZ 形式の圧縮ライブラリ

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  新しい Perl 互換正規表現ライブラリ - 8 ビットランタイムファイル

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [sparc64]

  Secure Sockets Layer ツールキット - 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libsvm3 (>= 3.21+ds) [sparc64]

  library implementing support vector machines

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: r-base-core

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-mathlib (>= 4.3.3) [sparc64]

  GNU R - スタンドアローンな数学ライブラリ

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  圧縮ライブラリ - ランタイム

vt のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	0.57721+ds-3+b1	694.3 kB	3,221.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	0.57721+ds-3+b1	821.5 kB	2,902.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0.57721+ds-3+b2	702.6 kB	2,706.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0.57721+ds-3+b1	637.2 kB	2,361.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.57721+ds-3+b1	657.9 kB	1,661.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	0.57721+ds-3+b2	695.5 kB	2,646.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0.57721+ds-3+b1	826.5 kB	3,065.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	0.57721+ds-3+b1	906.8 kB	5,619.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	0.57721+ds-3+b2	735.5 kB	2,777.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	0.57721+ds-3+b1	604.5 kB	3,505.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	0.57721+ds-3+b1	702.2 kB	3,218.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.57721+ds-3+b1	726.7 kB	3,090.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	0.57721+ds-3+b2	803.1 kB	2,342.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	0.57721+ds-3+b1	757.8 kB	2,834.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	0.57721+ds-3+b2	931.7 kB	2,642.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	0.57721+ds-3+b2	597.0 kB	3,097.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	0.57721+ds-3+b1	822.2 kB	2,813.0 kB	[ファイル一覧]