Paketti: vt (0.57721+ds-3 ja muut)

[ Source: vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Muut pakettiin vt liittyvät paketit

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, arm64, armhf, ia64, loong64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64, armhf]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2) [sparc64]

  easy-to-use client-side URL transfer library (GnuTLS flavour)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

  XZ-tiedostomuodon pakkauskirjasto

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  New Perl Compatible Regular Expression Library- 8 bit runtime files

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [sparc64]

  Secure Sockets Layer -työkalupakki - jaetut kirjastot

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: libsvm3 (>= 3.21+ds) [sparc64]

  library implementing support vector machines

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: r-base-core

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-mathlib (>= 4.3.3) [sparc64]

  GNU R standalone mathematics library

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi vt

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	0.57721+ds-3+b1	694.3 kt	3,221.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	0.57721+ds-3+b1	821.5 kt	2,902.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.57721+ds-3+b2	702.6 kt	2,706.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.57721+ds-3+b1	637.2 kt	2,361.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.57721+ds-3+b2	685.8 kt	1,809.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	0.57721+ds-3+b2	695.5 kt	2,646.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.57721+ds-3+b1	826.5 kt	3,065.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	0.57721+ds-3+b1	906.8 kt	5,619.0 kt	[tiedostoluettelo]
loong64 (epävirallinen siirros)	0.57721+ds-3+b1	688.3 kt	2,996.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	0.57721+ds-3+b2	735.5 kt	2,777.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.57721+ds-3+b1	604.5 kt	3,505.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	0.57721+ds-3+b1	702.2 kt	3,218.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.57721+ds-3+b1	726.7 kt	3,090.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	0.57721+ds-3+b2	803.1 kt	2,342.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.57721+ds-3+b1	757.8 kt	2,834.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	0.57721+ds-3+b2	931.7 kt	2,642.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	0.57721+ds-3+b2	597.0 kt	3,097.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	0.57721+ds-3+b1	822.2 kt	2,813.0 kt	[tiedostoluettelo]