Paket: vt (0.57721+ds-3 und andere)

[ Quellcode: vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Andere Pakete mit Bezug zu vt

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht arm64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, riscv64]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  Neue »Perl Compatible Regular Expression Library« - 8-Bit-Laufzeitdateien

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: r-base-core

  GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern

vt herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	0.57721+ds-3+b1	821,5 kB	2.902,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.57721+ds-3+b2	702,6 kB	2.706,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	0.57721+ds-3+b1	637,2 kB	2.361,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	0.57721+ds-3+b1	657,9 kB	1.661,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	0.57721+ds-3+b1	826,5 kB	3.065,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	0.57721+ds-3+b1	604,5 kB	3.505,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.57721+ds-3+b1	726,7 kB	3.090,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	0.57721+ds-3+b2	803,1 kB	2.342,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	0.57721+ds-3+b1	757,8 kB	2.834,0 kB	[Liste der Dateien]