Balík: vt (0.57721+ds-3 a iné)

[ Zdroj: vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom vt

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, arm64, armhf, ia64, loong64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64, armhf]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2) [sparc64]

  jednoducho použiteľná klientská knižnica na prenos URL - verzia GnuTLS

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  podporná knižnica GCC

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

  komprimačná knižnica formátu XZ

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  nová knižnica PCRE - 8-bitová dynamická knižnica

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [sparc64]

  sada nástrojov SSL (Secure Sockets Layer) - zdieľné knižnice

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: libsvm3 (>= 3.21+ds) [sparc64]

  library implementing support vector machines

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• dep: r-base-core

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

• dep: r-mathlib (>= 4.3.3) [sparc64]

  GNU R standalone mathematics library

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť vt

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	0.57721+ds-3+b1	694.3 kB	3,221.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	0.57721+ds-3+b1	821.5 kB	2,902.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	0.57721+ds-3+b2	702.6 kB	2,706.0 kB	[zoznam súborov]
armel	0.57721+ds-3+b1	637.2 kB	2,361.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	0.57721+ds-3+b2	685.8 kB	1,809.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	0.57721+ds-3+b2	695.5 kB	2,646.0 kB	[zoznam súborov]
i386	0.57721+ds-3+b1	826.5 kB	3,065.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	0.57721+ds-3+b1	906.8 kB	5,619.0 kB	[zoznam súborov]
loong64 (neoficiálny port)	0.57721+ds-3+b1	688.3 kB	2,996.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	0.57721+ds-3+b2	735.5 kB	2,777.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	0.57721+ds-3+b1	604.5 kB	3,505.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	0.57721+ds-3+b1	702.2 kB	3,218.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	0.57721+ds-3+b1	726.7 kB	3,090.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	0.57721+ds-3+b2	803.1 kB	2,342.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	0.57721+ds-3+b1	757.8 kB	2,834.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	0.57721+ds-3+b2	931.7 kB	2,642.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	0.57721+ds-3+b2	597.0 kB	3,097.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	0.57721+ds-3+b1	822.2 kB	2,813.0 kB	[zoznam súborov]