Pacote: vt (0.57721+ds-3 e outros)

[ Fonte: vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Outros pacotes relacionados a vt

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  bib. de alta qualid. de compactação de arqs. bas. em ordenação de blocos - exec

• dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, arm64, armhf, ia64, loong64, sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64, armhf]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2) [sparc64]

  biblioteca de transferência de URL do lado do cliente fácil de usar (sabor GnuTLS)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

  biblioteca de compressão para formato XZ

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  nova biblioteca de expressões regulares compatível com Perl - arquivos de execução 8 bit

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [sparc64]

  conjunto de ferramentas "Secure Socket Layer" (SSL) - bibliotecas compartilhadas

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: libsvm3 (>= 3.21+ds) [sparc64]

  library implementing support vector machines

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

• dep: r-base-core

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-mathlib (>= 4.3.3) [sparc64]

  GNU R standalone mathematics library

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de vt

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	0.57721+ds-3+b1	694.3 kB	3,221.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	0.57721+ds-3+b1	821.5 kB	2,902.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	0.57721+ds-3+b2	702.6 kB	2,706.0 kB	[lista de arquivos]
armel	0.57721+ds-3+b1	637.2 kB	2,361.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	0.57721+ds-3+b2	685.8 kB	1,809.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	0.57721+ds-3+b2	695.5 kB	2,646.0 kB	[lista de arquivos]
i386	0.57721+ds-3+b1	826.5 kB	3,065.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	0.57721+ds-3+b1	906.8 kB	5,619.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	0.57721+ds-3+b1	688.3 kB	2,996.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	0.57721+ds-3+b2	735.5 kB	2,777.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	0.57721+ds-3+b1	604.5 kB	3,505.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	0.57721+ds-3+b1	702.2 kB	3,218.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	0.57721+ds-3+b1	726.7 kB	3,090.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	0.57721+ds-3+b2	803.1 kB	2,342.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	0.57721+ds-3+b1	757.8 kB	2,834.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	0.57721+ds-3+b2	931.7 kB	2,642.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	0.57721+ds-3+b2	597.0 kB	3,097.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	0.57721+ds-3+b1	822.2 kB	2,813.0 kB	[lista de arquivos]