Paket: trinityrnaseq (2.15.2+dfsg-1 und andere)

[ Quellcode: trinityrnaseq  ]

RNA-Seq De novo Assembly

Trinity represents a novel method for the efficient and robust de novo reconstruction of transcriptomes from RNA-seq data. Trinity combines three independent software modules: Inchworm, Chrysalis, and Butterfly, applied sequentially to process large volumes of RNA-seq reads. Trinity partitions the sequence data into many individual de Bruijn graphs, each representing the transcriptional complexity at a given gene or locus, and then processes each graph independently to extract full-length splicing isoforms and to tease apart transcripts derived from paralogous genes.

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  dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	2.15.1+dfsg-2	1.656,3 kB	8.135,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	2.15.2+dfsg-1	1.696,9 kB	7.531,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.15.2+dfsg-1	1.622,4 kB	7.755,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.15.1+dfsg-2	1.717,4 kB	9.611,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	2.15.2+dfsg-1	1.635,4 kB	7.419,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	2.15.1+dfsg-2	1.654,5 kB	7.399,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	2.15.1+dfsg-2	1.664,4 kB	8.572,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.15.2+dfsg-1	1.672,4 kB	8.267,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.15.2+dfsg-1	1.663,5 kB	6.803,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	2.15.1+dfsg-2	1.726,5 kB	7.736,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	2.15.1+dfsg-2	1.576,3 kB	18.081,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	2.15.1+dfsg-2	1.676,7 kB	7.287,0 kB	[Liste der Dateien]