Paket: r-bioc-edger (4.4.2+dfsg-1 und andere)

[ Quellcode: r-bioc-edger  ]

Empirische Analyse von digitalen Genexpressionsdaten mit R

Bioconductor-Paket zur Differentialexpressionsanalyse eines vollkommen sequenzierten Transkriptom (RNA-seq) und digitalen Genexpressionsprofilen mit biologischer Replikation. Es verwendet empirische Bayes-Methoden und exakte Tests, die auf der negativen Binomialverteilung basieren. Es ist auch für die Differentialsignalanalyse mit anderen Typen von Zähldaten in der Größenordnung von Genomen verwendbar.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::r, interface::commandline, Rolle: Programm

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-edger

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• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [nicht alpha, ia64, loong64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: liblapack3

  Bibliothek von Routinen für Lineare Algebra (3) - gemeinsame Version

  oder liblapack.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

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  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  Paket nicht verfügbar

• dep: r-api-bioc-3.20 [nicht hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-limma (>= 3.41.5) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  linear models for microarray data

  dep: r-bioc-limma (>= 3.61.9) [nicht hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

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r-bioc-edger herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	4.4.2+dfsg-1	1.091,2 kB	1.331,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	4.4.2+dfsg-1	1.091,9 kB	1.315,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	4.4.2+dfsg-1	1.089,2 kB	1.331,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	4.0.16+dfsg-1	1.113,3 kB	1.522,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	4.0.16+dfsg-1	1.136,4 kB	1.806,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	4.4.2+dfsg-1	1.091,3 kB	1.330,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	4.0.16+dfsg-1	1.100,6 kB	1.432,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	4.4.2+dfsg-1	1.088,1 kB	1.335,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	4.4.2+dfsg-1	1.097,7 kB	1.397,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	4.4.2+dfsg-1	1.097,0 kB	1.331,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	4.4.2+dfsg-1	1.092,7 kB	1.295,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	4.4.2+dfsg-1	1.095,5 kB	1.319,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	4.0.16+dfsg-1	1.129,7 kB	1.493,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	4.4.2+dfsg-1	1.084,8 kB	2.231,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	4.0.16+dfsg-1	1.119,8 kB	1.451,0 kB	[Liste der Dateien]