Paket: ariba (2.14.7+ds-5 und andere)

[ Quellcode: ariba  ]

Antibiotic Resistance Identification By Assembly

ARIBA is a tool that identifies antibiotic resistance genes by running local assemblies. The input is a FASTA file of reference genes and paired sequencing reads. ARIBA reports which of the reference genes were found, plus detailed information on the quality of the assemblies and any variants between the sequencing reads and the reference genes.

Markierungen: Biologie: Nukleinsäuren, Feld: Biologie, field::biology:bioinformatics, implemented-in::python, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: role::program, scope::application, Zweck: Analyse

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  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
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  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k, mips64el]

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  dep: python3 (<< 3.11) [m68k]

  dep: python3 (<< 3.13) [alpha]

  dep: python3 (<< 3.14) [nicht alpha, m68k]

  dep: python3 (>= 3.12~) [nicht m68k]

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• dep: python3-bs4 [m68k]

  Fehlertoleranter Python-3-HTML-Parser

  dep: python3-bs4 (>= 4.1.0) [nicht m68k]

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• dep: python3-matplotlib

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• sug: spades

  genome assembler for single-cell and isolates data sets

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	2.14.7+ds-4	1.908,0 kB	20.531,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	2.14.7+ds-5	1.911,4 kB	20.596,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.14.7+ds-5	1.906,3 kB	20.732,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	2.14.6+ds-2+b1	1.910,0 kB	20.567,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2.14.7+ds-5	1.908,9 kB	20.740,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.14.7+ds-5	1.910,6 kB	20.732,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.14.7+ds-5	1.909,3 kB	20.524,0 kB	[Liste der Dateien]