Package: fastahack (1.0.0+dfsg-11 and others)
Links for fastahack
Debian Resources:
Download Source Package libfastahack:
- [libfastahack_1.0.0+dfsg-11.dsc]
- [libfastahack_1.0.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [libfastahack_1.0.0+dfsg-11.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Redskab for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer
Fastahack er et lille program til indeksering og udtrækning af sekvenser og undersekvenser fra FASTA-filer. Det inkluderede Fasta.cpp-bibliotek tilbyder en FASTA-læser og et indeksprogram, som kan indlejres i programmer, som vil have nytte af direkte læsning af undersekvenser fra FASTA-filer. Biblioteket håndterer automatisk oprettelse af indeksfil og brug.
Funktioner:
* FASTA-indeksoprettelse (.fai) for FASTA-filer * Sekvensudtrækning * Undersekvensudtrækning * Sekvensstatistik (i øjeblikket er kun entropi indeholdt)
Sekvens- og undersekvensudtrækning bruger fseek64 til at tilbyde hurtigst mulig udtrækning uden RAM-intensive operationer for filindlæsning. Dette gør fastahack til et nyttigt værktøj for bioinformatikere, som hurtigt skal udtrække mange undersekvenser fra en FASTA-referencesekvens.
Other Packages Related to fastahack
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.38) [not alpha, ia64, sh4]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
-
- dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)
- Bibliotek for entropimåling af bytestrømme
-
- dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f) [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, sparc64]
- Bibliotek for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer - bibliotek
- dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg) [not amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, sparc64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, hppa, ia64, m68k]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid
Download fastahack
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|---|
alpha (unofficial port) | 1.0.0+dfsg-11+b1 | 12.0 kB | 85.0 kB | [list of files] |
amd64 | 1.0.0+dfsg-11+b2 | 12.4 kB | 45.0 kB | [list of files] |
arm64 | 1.0.0+dfsg-11+b2 | 11.9 kB | 85.0 kB | [list of files] |
armel | 1.0.0+dfsg-11+b2 | 11.6 kB | 36.0 kB | [list of files] |
armhf | 1.0.0+dfsg-11+b2 | 11.6 kB | 36.0 kB | [list of files] |
hppa (unofficial port) | 1.0.0+dfsg-11+b1 | 12.1 kB | 37.0 kB | [list of files] |
i386 | 1.0.0+dfsg-11+b2 | 12.6 kB | 44.0 kB | [list of files] |
ia64 (unofficial port) | 1.0.0+dfsg-11 | 13.3 kB | 49.0 kB | [list of files] |
m68k (unofficial port) | 1.0.0+dfsg-11+b1 | 12.2 kB | 44.0 kB | [list of files] |
mips64el | 1.0.0+dfsg-11+b2 | 12.1 kB | 86.0 kB | [list of files] |
ppc64 (unofficial port) | 1.0.0+dfsg-11+b1 | 12.4 kB | 85.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 1.0.0+dfsg-11+b2 | 12.3 kB | 85.0 kB | [list of files] |
riscv64 | 1.0.0+dfsg-11+b2 | 11.7 kB | 37.0 kB | [list of files] |
s390x | 1.0.0+dfsg-11+b2 | 12.0 kB | 41.0 kB | [list of files] |
sh4 (unofficial port) | 1.0.0+dfsg-11+b1 | 12.8 kB | 84.0 kB | [list of files] |
sparc64 (unofficial port) | 1.0.0+dfsg-11+b1 | 11.7 kB | 1,046.0 kB | [list of files] |
x32 (unofficial port) | 1.0.0+dfsg-11+b1 | 12.3 kB | 40.0 kB | [list of files] |