Package: libfastahack0 (1.0.0+dfsg-11 and others)

[ Source: libfastahack  ]

Bibliotek for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer - bibliotek

Fastahack er et lille program til indeksering og udtrækning af sekvenser og undersekvenser fra FASTA-filer. Det inkluderede Fasta.cpp-bibliotek tilbyder en FASTA-læser og et indeksprogram, som kan indlejres i programmer, som vil have nytte af direkte læsning af undersekvenser fra FASTA-filer. Biblioteket håndterer automatisk oprettelse af indeksfil og brug.

Funktioner:

 * FASTA-indeksoprettelse (.fai) for FASTA-filer
 * Sekvensudtrækning
 * Undersekvensudtrækning
 * Sekvensstatistik (i øjeblikket er kun entropi indeholdt)

Sekvens- og undersekvensudtrækning bruger fseek64 til at tilbyde hurtigst mulig udtrækning uden RAM-intensive operationer for filindlæsning. Dette gør fastahack til et nyttigt værktøj for bioinformatikere, som hurtigt skal udtrække mange undersekvenser fra en FASTA-referencesekvens.

Denne pakke indeholder det dynamiske bibliotek.

Tags: Role: Shared Library

Other Packages Related to libfastahack0

• dep: libc6 (>= 2.38) [not alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC støttebibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid

Download libfastahack0

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.0.0+dfsg-11+b1	23.1 kB	83.0 kB	[list of files]
amd64	1.0.0+dfsg-11+b2	25.8 kB	83.0 kB	[list of files]
arm64	1.0.0+dfsg-11+b2	23.1 kB	87.0 kB	[list of files]
armel	1.0.0+dfsg-11+b2	23.6 kB	74.0 kB	[list of files]
armhf	1.0.0+dfsg-11+b2	23.7 kB	58.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	1.0.0+dfsg-11+b1	26.8 kB	75.0 kB	[list of files]
i386	1.0.0+dfsg-11+b2	26.7 kB	78.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	1.0.0+dfsg-11	30.7 kB	117.0 kB	[list of files]
loong64 (unofficial port)	1.0.0+dfsg-11+b1	23.4 kB	82.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.0.0+dfsg-11+b1	25.2 kB	74.0 kB	[list of files]
mips64el	1.0.0+dfsg-11+b2	24.0 kB	90.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.0.0+dfsg-11+b1	25.5 kB	146.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.0.0+dfsg-11+b2	25.8 kB	87.0 kB	[list of files]
riscv64	1.0.0+dfsg-11+b2	23.9 kB	62.0 kB	[list of files]
s390x	1.0.0+dfsg-11+b2	24.6 kB	74.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.0.0+dfsg-11+b1	27.2 kB	82.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.0.0+dfsg-11+b1	21.5 kB	1,051.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.0.0+dfsg-11+b1	25.1 kB	70.0 kB	[list of files]