tüm seçenekler
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Kaynak: libfastahack  ]

Paket: fastahack (1.0.0+dfsg-11 ve diğerleri)

fastahack için bağlantılar

Screenshot

Debian Kaynakları:

libfastahack Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Benzer paketler:

utility for indexing and sequence extraction from FASTA files

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

fastahack ile İlgili Diğer Paketler

  • bağımlılıklar
  • tavsiye edilen
  • önerilen
  • enhances

fastahack indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari Sürüm Paket Boyutu Kurulu Boyut Dosyalar
alpha (resmi olmayan port) 1.0.0+dfsg-11 11,7 kB84,0 kB [dosya listesi]
amd64 1.0.0+dfsg-11+b2 12,4 kB45,0 kB [dosya listesi]
arm64 1.0.0+dfsg-11+b2 11,9 kB85,0 kB [dosya listesi]
armel 1.0.0+dfsg-11+b2 11,6 kB36,0 kB [dosya listesi]
armhf 1.0.0+dfsg-11+b2 11,6 kB36,0 kB [dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port) 1.0.0+dfsg-11+b1 12,1 kB37,0 kB [dosya listesi]
i386 1.0.0+dfsg-11+b2 12,6 kB44,0 kB [dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port) 1.0.0+dfsg-11 13,3 kB49,0 kB [dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port) 1.0.0+dfsg-11+b1 12,2 kB44,0 kB [dosya listesi]
mips64el 1.0.0+dfsg-11+b2 12,1 kB86,0 kB [dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port) 1.0.0+dfsg-11+b1 12,4 kB85,0 kB [dosya listesi]
ppc64el 1.0.0+dfsg-11+b2 12,3 kB85,0 kB [dosya listesi]
riscv64 1.0.0+dfsg-11+b2 11,7 kB37,0 kB [dosya listesi]
s390x 1.0.0+dfsg-11+b2 12,0 kB41,0 kB [dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port) 1.0.0+dfsg-11+b1 12,8 kB84,0 kB [dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port) 1.0.0+dfsg-11+b1 11,7 kB1.046,0 kB [dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port) 1.0.0+dfsg-11+b1 12,3 kB40,0 kB [dosya listesi]