套件：fastahack（1.0.0+dfsg-11 以及其他的）

fastahack 的相關連結

Debian 的資源：

下載原始碼套件 libfastahack：

維護小組：

外部的資源：

主頁 [github.com]

相似套件：

utility for indexing and sequence extraction from FASTA files

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

其他與 fastahack 有關的套件

依賴

推薦

建議

增強

dep: libc6 (>= 2.38) [除 alpha, ia64, sh4]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

library for entropy measurement of byte streams
dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f) [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, sparc64]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg) [除 amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, sparc64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [除 armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

GCC 支援函式庫

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 支援函式庫
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 支援函式庫
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ Library v3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime

下載 fastahack

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	1.0.0+dfsg-11	11。7 kB	84。0 kB	[檔案列表]
amd64	1.0.0+dfsg-11+b2	12。4 kB	45。0 kB	[檔案列表]
arm64	1.0.0+dfsg-11+b2	11。9 kB	85。0 kB	[檔案列表]
armel	1.0.0+dfsg-11+b2	11。6 kB	36。0 kB	[檔案列表]
armhf	1.0.0+dfsg-11+b2	11。6 kB	36。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	1.0.0+dfsg-11+b1	12。1 kB	37。0 kB	[檔案列表]
i386	1.0.0+dfsg-11+b2	12。6 kB	44。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	1.0.0+dfsg-11	13。3 kB	49。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	1.0.0+dfsg-11+b1	12。2 kB	44。0 kB	[檔案列表]
mips64el	1.0.0+dfsg-11+b2	12。1 kB	86。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	1.0.0+dfsg-11+b1	12。4 kB	85。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	1.0.0+dfsg-11+b2	12。3 kB	85。0 kB	[檔案列表]
riscv64	1.0.0+dfsg-11+b2	11。7 kB	37。0 kB	[檔案列表]
s390x	1.0.0+dfsg-11+b2	12。0 kB	41。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	1.0.0+dfsg-11+b1	12。8 kB	84。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	1.0.0+dfsg-11+b1	11。7 kB	1，046。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	1.0.0+dfsg-11+b1	12。3 kB	40。0 kB	[檔案列表]