Package: damapper (0.0+git20240314.b025cf9-1 and others)

[ Source: damapper  ]

Lang læsning til reference genom-oversættelsesværktøj

Anerkendt som Damapper Library, dette er et kommandolinjeværktøj til lang læsning af en reference genom-oversættelse.

For en given referencedatabase »X« og læst blok »Y« laver damapper den enlige fil »Y.X.las«. Hver resultatfil sorteres via A-læsninger og hvis et match er en kæde af lokale sammenligninger, så fremgår LA'erne i kæden i stigende rækkefølge for A-koordinater.

HPC.damapper skriver et UNIX-skalskript til standardud, der oversætter hver læsning i blokke <first> til <last> for database <reads> til en referencesekvens <ref>. Hvis <last> mangler så oversættes kun blokken <first>, og hvis <first> også mangler så oversættes alle blokke i databasen.

Denne pakke indeholder de binære filer damapper og HPC.damapper.

Other Packages Related to damapper

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

Download damapper

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.0+git20240314.b025cf9-1	104.9 kB	428.0 kB	[list of files]
amd64	0.0+git20240314.b025cf9-1	109.3 kB	316.0 kB	[list of files]
arm64	0.0+git20240314.b025cf9-1	96.8 kB	364.0 kB	[list of files]
armel	0.0+git20240314.b025cf9-1	98.1 kB	302.0 kB	[list of files]
armhf	0.0+git20240314.b025cf9-1	97.4 kB	226.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	0.0+git20240314.b025cf9-1	103.7 kB	308.0 kB	[list of files]
i386	0.0+git20240314.b025cf9-1	109.5 kB	346.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	0.0+git20210330.ab45103-2	128.4 kB	549.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	0.0+git20240314.b025cf9-1	95.0 kB	298.0 kB	[list of files]
mips64el	0.0+git20240314.b025cf9-1	100.2 kB	437.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	0.0+git20240314.b025cf9-1	111.2 kB	428.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.0+git20240314.b025cf9-1	112.4 kB	428.0 kB	[list of files]
riscv64	0.0+git20240314.b025cf9-1	106.6 kB	248.0 kB	[list of files]
s390x	0.0+git20240314.b025cf9-1	116.5 kB	336.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	0.0+git20240314.b025cf9-1	120.6 kB	298.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	0.0+git20240314.b025cf9-1	95.8 kB	2,094.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	0.0+git20240314.b025cf9-1	106.3 kB	298.0 kB	[list of files]