Paquet : damapper (0.0+git20240314.b025cf9-1 et autres)

[ Paquet source : damapper  ]

long read to reference genome mapping tool

Recognised as the Damapper Library, this is a long read to reference genome mapping command line tool.

For a given reference database 'X' and read block 'Y', damapper produces the single file 'Y.X.las'. Each output file is sorted in order of the A-reads, and if a match is a chain of local alignments, then the LA's in the chain occur in increasing order of A-coordinates.

HPC.damapper writes a UNIX shell script to the standard output that maps every read in blocks <first> to <last> of database <reads> to a reference sequence <ref>. If <last> is missing then only the single block <first> is mapped, and if <first> is also missing then all blocks of the database are mapped.

This package contains the damapper and HPC.damapper binaries.

Autres paquets associés à damapper

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, loong64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

Télécharger damapper

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	0.0+git20240314.b025cf9-1	104,9 ko	428,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	0.0+git20240314.b025cf9-1	109,3 ko	316,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.0+git20240314.b025cf9-1	96,8 ko	364,0 ko	[liste des fichiers]
armel	0.0+git20240314.b025cf9-1	98,1 ko	302,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.0+git20240314.b025cf9-1	97,4 ko	226,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	0.0+git20240314.b025cf9-1	103,7 ko	308,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.0+git20240314.b025cf9-1	109,5 ko	346,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	0.0+git20210330.ab45103-2	128,4 ko	549,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	0.0+git20240314.b025cf9-1	99,6 ko	316,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	0.0+git20240314.b025cf9-1	95,0 ko	298,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	0.0+git20240314.b025cf9-1	100,2 ko	437,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	0.0+git20240314.b025cf9-1	111,2 ko	428,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.0+git20240314.b025cf9-1	112,4 ko	428,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	0.0+git20240314.b025cf9-1	106,6 ko	248,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	0.0+git20240314.b025cf9-1	116,5 ko	336,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	0.0+git20240314.b025cf9-1	120,6 ko	298,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	0.0+git20240314.b025cf9-1	95,8 ko	2 094,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	0.0+git20240314.b025cf9-1	106,3 ko	298,0 ko	[liste des fichiers]