Paketti: damapper (0.0+git20240314.b025cf9-1 ja muut)

[ Source: damapper  ]

long read to reference genome mapping tool

Recognised as the Damapper Library, this is a long read to reference genome mapping command line tool.

For a given reference database 'X' and read block 'Y', damapper produces the single file 'Y.X.las'. Each output file is sorted in order of the A-reads, and if a match is a chain of local alignments, then the LA's in the chain occur in increasing order of A-coordinates.

HPC.damapper writes a UNIX shell script to the standard output that maps every read in blocks <first> to <last> of database <reads> to a reference sequence <ref>. If <last> is missing then only the single block <first> is mapped, and if <first> is also missing then all blocks of the database are mapped.

This package contains the damapper and HPC.damapper binaries.

Muut pakettiin damapper liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

Imuroi damapper

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	0.0+git20240314.b025cf9-1	104.9 kt	428.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	0.0+git20240314.b025cf9-1	109.3 kt	316.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.0+git20240314.b025cf9-1	96.8 kt	364.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.0+git20240314.b025cf9-1	98.1 kt	302.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.0+git20240314.b025cf9-1	97.4 kt	226.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	0.0+git20240314.b025cf9-1	103.7 kt	308.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.0+git20240314.b025cf9-1	109.5 kt	346.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	0.0+git20210330.ab45103-2	128.4 kt	549.0 kt	[tiedostoluettelo]
loong64 (epävirallinen siirros)	0.0+git20240314.b025cf9-1	99.6 kt	316.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	0.0+git20240314.b025cf9-1	95.0 kt	298.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.0+git20240314.b025cf9-1	100.2 kt	437.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	0.0+git20240314.b025cf9-1	111.2 kt	428.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.0+git20240314.b025cf9-1	112.4 kt	428.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	0.0+git20240314.b025cf9-1	106.6 kt	248.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.0+git20240314.b025cf9-1	116.5 kt	336.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	0.0+git20240314.b025cf9-1	120.6 kt	298.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	0.0+git20240314.b025cf9-1	95.8 kt	2,094.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	0.0+git20240314.b025cf9-1	106.3 kt	298.0 kt	[tiedostoluettelo]