Pakiet: damapper (0.0+git20240314.b025cf9-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: damapper  ]

long read to reference genome mapping tool

Recognised as the Damapper Library, this is a long read to reference genome mapping command line tool.

For a given reference database 'X' and read block 'Y', damapper produces the single file 'Y.X.las'. Each output file is sorted in order of the A-reads, and if a match is a chain of local alignments, then the LA's in the chain occur in increasing order of A-coordinates.

HPC.damapper writes a UNIX shell script to the standard output that maps every read in blocks <first> to <last> of database <reads> to a reference sequence <ref>. If <last> is missing then only the single block <first> is mapped, and if <first> is also missing then all blocks of the database are mapped.

This package contains the damapper and HPC.damapper binaries.

Inne pakiety związane z damapper

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, loong64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

Pobieranie damapper

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	0.0+git20240314.b025cf9-1	104,9 KiB	428,0 KiB	[lista plików]
amd64	0.0+git20240314.b025cf9-1	109,3 KiB	316,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.0+git20240314.b025cf9-1	96,8 KiB	364,0 KiB	[lista plików]
armel	0.0+git20240314.b025cf9-1	98,1 KiB	302,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.0+git20240314.b025cf9-1	97,4 KiB	226,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	0.0+git20240314.b025cf9-1	103,7 KiB	308,0 KiB	[lista plików]
i386	0.0+git20240314.b025cf9-1	109,5 KiB	346,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	0.0+git20210330.ab45103-2	128,4 KiB	549,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	0.0+git20240314.b025cf9-1	99,6 KiB	316,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	0.0+git20240314.b025cf9-1	95,0 KiB	298,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.0+git20240314.b025cf9-1	100,2 KiB	437,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	0.0+git20240314.b025cf9-1	111,2 KiB	428,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.0+git20240314.b025cf9-1	112,4 KiB	428,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.0+git20240314.b025cf9-1	106,6 KiB	248,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.0+git20240314.b025cf9-1	116,5 KiB	336,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	0.0+git20240314.b025cf9-1	120,6 KiB	298,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	0.0+git20240314.b025cf9-1	95,8 KiB	2 094,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	0.0+git20240314.b025cf9-1	106,3 KiB	298,0 KiB	[lista plików]