Paket: damapper (0.0+git20240314.b025cf9-1 och andra)

[ Källkod: damapper  ]

long read to reference genome mapping tool

Recognised as the Damapper Library, this is a long read to reference genome mapping command line tool.

For a given reference database 'X' and read block 'Y', damapper produces the single file 'Y.X.las'. Each output file is sorted in order of the A-reads, and if a match is a chain of local alignments, then the LA's in the chain occur in increasing order of A-coordinates.

HPC.damapper writes a UNIX shell script to the standard output that maps every read in blocks <first> to <last> of database <reads> to a reference sequence <ref>. If <last> is missing then only the single block <first> is mapped, and if <first> is also missing then all blocks of the database are mapped.

This package contains the damapper and HPC.damapper binaries.

Andra paket besläktade med damapper

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

Hämta damapper

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	0.0+git20240314.b025cf9-1	104,9 kbyte	428,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	0.0+git20240314.b025cf9-1	109,3 kbyte	316,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	0.0+git20240314.b025cf9-1	96,8 kbyte	364,0 kbyte	[filförteckning]
armel	0.0+git20240314.b025cf9-1	98,1 kbyte	302,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	0.0+git20240314.b025cf9-1	97,4 kbyte	226,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	0.0+git20240314.b025cf9-1	103,7 kbyte	308,0 kbyte	[filförteckning]
i386	0.0+git20240314.b025cf9-1	109,5 kbyte	346,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	0.0+git20210330.ab45103-2	128,4 kbyte	549,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	0.0+git20240314.b025cf9-1	95,0 kbyte	298,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	0.0+git20240314.b025cf9-1	100,2 kbyte	437,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	0.0+git20240314.b025cf9-1	111,2 kbyte	428,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	0.0+git20240314.b025cf9-1	112,4 kbyte	428,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	0.0+git20240314.b025cf9-1	106,6 kbyte	248,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	0.0+git20240314.b025cf9-1	116,5 kbyte	336,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	0.0+git20240314.b025cf9-1	120,6 kbyte	298,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	0.0+git20240314.b025cf9-1	95,8 kbyte	2.094,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	0.0+git20240314.b025cf9-1	106,3 kbyte	298,0 kbyte	[filförteckning]