všetky možnosti
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Zdroj: damapper  ]

Balík: damapper (0.0+git20240314.b025cf9-1 a iné)

Odkazy pre damapper

Screenshot

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík damapper:

Správcovia:

Externé zdroje:

Podobné balíky:

long read to reference genome mapping tool

Recognised as the Damapper Library, this is a long read to reference genome mapping command line tool.

For a given reference database 'X' and read block 'Y', damapper produces the single file 'Y.X.las'. Each output file is sorted in order of the A-reads, and if a match is a chain of local alignments, then the LA's in the chain occur in increasing order of A-coordinates.

HPC.damapper writes a UNIX shell script to the standard output that maps every read in blocks <first> to <last> of database <reads> to a reference sequence <ref>. If <last> is missing then only the single block <first> is mapped, and if <first> is also missing then all blocks of the database are mapped.

This package contains the damapper and HPC.damapper binaries.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom damapper

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • vylepšuje

Stiahnuť damapper

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Verzia Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
alpha (neoficiálny port) 0.0+git20240314.b025cf9-1 104.9 kB428.0 kB [zoznam súborov]
amd64 0.0+git20240314.b025cf9-1 109.3 kB316.0 kB [zoznam súborov]
arm64 0.0+git20240314.b025cf9-1 96.8 kB364.0 kB [zoznam súborov]
armel 0.0+git20240314.b025cf9-1 98.1 kB302.0 kB [zoznam súborov]
armhf 0.0+git20240314.b025cf9-1 97.4 kB226.0 kB [zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port) 0.0+git20240314.b025cf9-1 103.7 kB308.0 kB [zoznam súborov]
i386 0.0+git20240314.b025cf9-1 109.5 kB346.0 kB [zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port) 0.0+git20210330.ab45103-2 128.4 kB549.0 kB [zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port) 0.0+git20240314.b025cf9-1 95.0 kB298.0 kB [zoznam súborov]
mips64el 0.0+git20240314.b025cf9-1 100.2 kB437.0 kB [zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port) 0.0+git20240314.b025cf9-1 111.2 kB428.0 kB [zoznam súborov]
ppc64el 0.0+git20240314.b025cf9-1 112.4 kB428.0 kB [zoznam súborov]
riscv64 0.0+git20240314.b025cf9-1 106.6 kB248.0 kB [zoznam súborov]
s390x 0.0+git20240314.b025cf9-1 116.5 kB336.0 kB [zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port) 0.0+git20240314.b025cf9-1 120.6 kB298.0 kB [zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port) 0.0+git20240314.b025cf9-1 95.8 kB2,094.0 kB [zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port) 0.0+git20240314.b025cf9-1 106.3 kB298.0 kB [zoznam súborov]