Пакунок: lagan (2.0-10 and others)

[ Source: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Інші пакунки пов'язані з lagan

• dep: libc6 (>= 2.34) [not arm64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, riscv64]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

Завантажити lagan

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	2.0-10	179.9 kB	834.0 kB	[список файлів]
arm64	2.0-10+b2	173.8 kB	1,771.0 kB	[список файлів]
armel	2.0-10	163.2 kB	691.0 kB	[список файлів]
armhf	2.0-10	162.4 kB	583.0 kB	[список файлів]
i386	2.0-10	186.7 kB	831.0 kB	[список файлів]
mips64el	2.0-10	182.3 kB	1,924.0 kB	[список файлів]
ppc64el	2.0-10	199.0 kB	1,898.0 kB	[список файлів]
riscv64	2.0-10	180.8 kB	682.0 kB	[список файлів]
s390x	2.0-10	186.6 kB	802.0 kB	[список файлів]