Paket: stacks (2.68+dfsg-2 ve diğerleri)
stacks için bağlantılar
Debian Kaynakları:
- Hata Raporları
- Developer Information
- Debian Değişim Günlüğü
- Telif Hakkı Dosyası
- Debian Yama Takipçisi
stacks Kaynak Paketini İndir:
Geliştiriciler:
Dış Kaynaklar:
- Ana Sayfa [creskolab.uoregon.edu]
Benzer paketler:
pipeline for building loci from short-read DNA sequences
Stacks is a software pipeline for building loci from short-read sequences, such as those generated on the Illumina platform. Stacks was developed to work with restriction enzyme-based data, such as RAD-seq, for the purpose of building genetic maps and conducting population genomics and phylogeography.
Note that this package installs Stacks such that all commands must be run as: $ stacks <cmdname> <args>
stacks ile İlgili Diğer Paketler
|
|
|
|
-
- dep: bsdextrautils
- extra utilities from 4.4BSD-Lite
-
- dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, sh4 değil]
- GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
-
- dep: libdbi-perl
- Perl Database Interface (DBI)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, s390x, x32]
- GCC support library
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC support library
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC support library
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) support library
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]
- GNU Standard C++ Library v3
- dep: libstdc++6 (>= 14) [ia64, m68k değil]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- compression library - runtime
-
- rec: libspreadsheet-writeexcel-perl
- module to create Excel spreadsheets
-
- rec: littler
- GNU R scripting and command-line front-end -- transition package
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket r-cran-littler
-
- sug: gdb
- GNU Debugger
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket gdb-minimal
stacks indir
Mimari | Sürüm | Paket Boyutu | Kurulu Boyut | Dosyalar |
---|---|---|---|---|
alpha (resmi olmayan port) | 2.68+dfsg-2 | 1.112,6 kB | 6.814,0 kB | [dosya listesi] |
amd64 | 2.68+dfsg-2 | 1.231,5 kB | 6.161,0 kB | [dosya listesi] |
arm64 | 2.68+dfsg-2 | 1.057,3 kB | 5.829,0 kB | [dosya listesi] |
armel | 2.68+dfsg-2 | 1.024,3 kB | 5.681,0 kB | [dosya listesi] |
armhf | 2.68+dfsg-2 | 1.046,8 kB | 4.081,0 kB | [dosya listesi] |
hppa (resmi olmayan port) | 2.68+dfsg-2 | 1.082,4 kB | 5.478,0 kB | [dosya listesi] |
i386 | 2.68+dfsg-2 | 1.301,0 kB | 6.437,0 kB | [dosya listesi] |
ia64 (resmi olmayan port) | 2.66+dfsg-1+b1 | 1.286,9 kB | 11.193,0 kB | [dosya listesi] |
m68k (resmi olmayan port) | 2.68+dfsg-2 | 1.104,3 kB | 5.753,0 kB | [dosya listesi] |
mips64el | 2.68+dfsg-2 | 1.123,1 kB | 7.726,0 kB | [dosya listesi] |
ppc64 (resmi olmayan port) | 2.68+dfsg-2 | 1.151,5 kB | 7.749,0 kB | [dosya listesi] |
ppc64el | 2.68+dfsg-2 | 1.170,8 kB | 7.109,0 kB | [dosya listesi] |
riscv64 | 2.68+dfsg-2 | 1.148,9 kB | 4.409,0 kB | [dosya listesi] |
s390x | 2.68+dfsg-2 | 1.157,7 kB | 6.289,0 kB | [dosya listesi] |
sh4 (resmi olmayan port) | 2.68+dfsg-2 | 1.348,7 kB | 5.689,0 kB | [dosya listesi] |
sparc64 (resmi olmayan port) | 2.68+dfsg-2 | 984,4 kB | 12.602,0 kB | [dosya listesi] |
x32 (resmi olmayan port) | 2.68+dfsg-2 | 1.236,8 kB | 5.813,0 kB | [dosya listesi] |