Pakiet: lagan (2.0-10)

[ Pakiet źródłowy: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Inne pakiety związane z lagan

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie lagan

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	179,9 KiB	834,0 KiB	[lista plików]
arm64	170,4 KiB	1 770,0 KiB	[lista plików]
armel	163,2 KiB	691,0 KiB	[lista plików]
armhf	162,4 KiB	583,0 KiB	[lista plików]
i386	186,7 KiB	831,0 KiB	[lista plików]
mips64el	182,3 KiB	1 924,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	199,0 KiB	1 898,0 KiB	[lista plików]
s390x	186,6 KiB	802,0 KiB	[lista plików]