Paketti: lagan (2.0-10 ja muut)

[ Source: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Muut pakettiin lagan liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei arm64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, riscv64]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

Imuroi lagan

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	2.0-10	179.9 kt	834.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	2.0-10+b2	173.8 kt	1,771.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	2.0-10	163.2 kt	691.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	2.0-10	162.4 kt	583.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	2.0-10	186.7 kt	831.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	2.0-10	182.3 kt	1,924.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	2.0-10	199.0 kt	1,898.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	2.0-10	180.8 kt	682.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	2.0-10	186.6 kt	802.0 kt	[tiedostoluettelo]