Pakket: lagan (2.0-10 en anderen)

[ Bron: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Andere aan lagan gerelateerde pakketten

• dep: libc6 (>= 2.34) [niet arm64]

  GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
  Ook een virtueel pakket geboden door: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [niet armel, armhf, riscv64]

  GCC support bibliotheek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ Library v3

lagan downloaden

Pakket downloaden voor alle beschikbare platforms

Platform	Versie	Pakketgrootte	Geïnstalleerde grootte	Bestanden
amd64	2.0-10	179,9 kB	834,0 kB	[overzicht]
arm64	2.0-10+b2	173,8 kB	1.771,0 kB	[overzicht]
armel	2.0-10	163,2 kB	691,0 kB	[overzicht]
armhf	2.0-10	162,4 kB	583,0 kB	[overzicht]
i386	2.0-10	186,7 kB	831,0 kB	[overzicht]
mips64el	2.0-10	182,3 kB	1.924,0 kB	[overzicht]
ppc64el	2.0-10	199,0 kB	1.898,0 kB	[overzicht]
riscv64	2.0-10	180,8 kB	682,0 kB	[overzicht]
s390x	2.0-10	186,6 kB	802,0 kB	[overzicht]