Paket: lagan (2.0-10 und andere)

[ Quellcode: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Andere Pakete mit Bezug zu lagan

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht arm64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, riscv64]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

lagan herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	2.0-10	179,9 kB	834,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.0-10+b2	173,8 kB	1.771,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	2.0-10	163,2 kB	691,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	2.0-10	162,4 kB	583,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	2.0-10	186,7 kB	831,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2.0-10	182,3 kB	1.924,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.0-10	199,0 kB	1.898,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.0-10	180,8 kB	682,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	2.0-10	186,6 kB	802,0 kB	[Liste der Dateien]