Paket: snpomatic (1.0-7 och andra)

[ Källkod: snpomatic  ]

fast, stringent short-read mapping software

High throughput sequencing technologies generate large amounts of short reads. Mapping these to a reference sequence consumes large amounts of processing time and memory, and read mapping errors can lead to noisy or incorrect alignments.

SNP-o-matic is a fast, stringent short-read mapping software. It supports a multitude of output types and formats, for uses in filtering reads, alignments, sequence-based genotyping calls, assisted reassembly of contigs etc.

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

Andra paket besläktade med snpomatic

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, arm64, ia64, loong64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC stödbibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC stödbibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ej ia64]

  GNU standardbibliotek v3 för C++

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Hämta snpomatic

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	1.0-7	76,0 kbyte	217,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	1.0-7	83,6 kbyte	208,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.0-7+b1	72,4 kbyte	217,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.0-7	66,4 kbyte	167,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.0-7	67,5 kbyte	127,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	1.0-7	76,0 kbyte	180,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.0-7	85,9 kbyte	211,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	1.0-5	106,7 kbyte	393,0 kbyte	[filförteckning]
loong64 (inofficiell anpassning)	1.0-7	71,7 kbyte	185,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	1.0-7	73,6 kbyte	183,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.0-7	74,8 kbyte	222,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	1.0-7	80,1 kbyte	280,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.0-7	82,2 kbyte	216,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.0-7	77,9 kbyte	156,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.0-7	79,3 kbyte	204,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	1.0-7	90,2 kbyte	215,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	1.0-7	67,5 kbyte	1.050,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	1.0-7	83,3 kbyte	199,0 kbyte	[filförteckning]